Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EEF1A1P68104 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EEF1A1P68104 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EEF1A1P68104 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms