Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCS1P62166 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCS1P62166 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
NCS1P62166 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCS1P62166 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCS1P62166 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms