Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFM1P61960 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFM1P61960 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFM1P61960 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFM1P61960 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFM1P61960 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFM1P61960 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFM1P61960 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFM1P61960 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFM1P61960 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UFM1P61960 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFM1P61960 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFM1P61960 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UFM1P61960 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UFM1P61960 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UFM1P61960 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UFM1P61960 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UFM1P61960 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms