Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LOXL3P58215 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL3P58215 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms