Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC4P56524 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC4P56524 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms