Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN5P54829 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN5P54829 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN5P54829 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms