Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPHB4P54760 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPHB4P54760 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms