Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF140P52738 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF140P52738 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF140P52738 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms