Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPOLAP51003 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAPOLAP51003 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAPOLAP51003 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms