Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms