Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRIP1P48552 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP1P48552 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms