Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAGEA1P43355 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAGEA1P43355 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAGEA1P43355 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms