Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MLH1P40692 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MLH1P40692 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MLH1P40692 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MLH1P40692 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MLH1P40692 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MLH1P40692 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH1P40692 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MLH1P40692 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MLH1P40692 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH1P40692 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH1P40692 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH1P40692 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH1P40692 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MLH1P40692 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MLH1P40692 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH1P40692 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH1P40692 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218 ms