Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 GPP1YIL053W 753 nt5.59□□□□□ -1.51
PDR11P40550 DPH1YIL103W 1278 nt5.59□□□□□ -1.51
PDR11P40550 AHA1YDR214W 1053 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 OTU1YFL044C 906 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YIL171WYIL171W 330 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 SFK1YKL051W 1062 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 OCA5YHL029C 2040 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 PHO87YCR037C 2772 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 CEX1YOR112W 2286 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 DUG1YFR044C 1446 nt5.58□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 MDY2YOL111C 639 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 RCM1YNL022C 1473 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 THI13YDL244W 1023 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YIL152WYIL152W 708 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 THI11YJR156C 1023 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 IMP1YMR150C 573 nt5.57□□□□□ -1.52
PDR11P40550 NMT1YLR195C 1368 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 MSW1YDR268W 1140 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 ASC1YMR116C 960 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 ODC2YOR222W 924 nt5.56□□□□□ -1.52
PDR11P40550 AIM3YBR108W 2844 nt5.55□□□□□ -1.52
PDR11P40550 CTT1YGR088W 1689 nt5.55□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YEL045CYEL045C 426 nt5.55□□□□□ -1.52
PDR11P40550 COG5YNL051W 1212 nt5.55□□□□□ -1.52
PDR11P40550 PRD1YCL057W 2139 nt5.55□□□□□ -1.52
PDR11P40550 HXT7YDR342C 1713 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 HXT6YDR343C 1713 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 TRF5YNL299W 1929 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 HMX1YLR205C 954 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YDC1YPL087W 954 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 RIM15YFL033C 5313 nt5.54□□□□□ -1.52
PDR11P40550 ARG4YHR018C 1392 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 ATF1YOR377W 1578 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 SIR2YDL042C 1689 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 SPC19YDR201W 498 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YIM1YMR152W 1098 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 MRP51YPL118W 1035 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 YBR219CYBR219C 384 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 TFC6YDR362C 2019 nt5.53□□□□□ -1.52
PDR11P40550 PPQ1YPL179W 1650 nt5.52□□□□□ -1.53
PDR11P40550 SSH1YBR283C 1473 nt5.52□□□□□ -1.53
PDR11P40550 ILV5YLR355C 1188 nt5.52□□□□□ -1.53
PDR11P40550 TUP1YCR084C 2142 nt5.52□□□□□ -1.53
PDR11P40550 DNF2YDR093W 4839 nt5.52□□□□□ -1.53
PDR11P40550 ELO2YCR034W 1044 nt5.51□□□□□ -1.53
PDR11P40550 YDR090CYDR090C 933 nt5.51□□□□□ -1.53
PDR11P40550 RPL24AYGL031C 468 nt5.51□□□□□ -1.53
PDR11P40550 PEX30YLR324W 1572 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 RAD16YBR114W 2373 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 STE13YOR219C 2796 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 VPS30YPL120W 1674 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 HGH1YGR187C 1185 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 HEM15YOR176W 1182 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 PMA1YGL008C 2757 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 RPG1YBR079C 2895 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 HOYDL227C 1761 nt5.5□□□□□ -1.53
PDR11P40550 HLJ1YMR161W 675 nt5.49□□□□□ -1.53
PDR11P40550 RPS0AYGR214W 759 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 TDA7YNL176C 1911 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 PXA1YPL147W 2613 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 SGN1YIR001C 753 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 RPL18BYNL301C 561 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 ROD1YOR018W 2514 nt5.48□□□□□ -1.53
PDR11P40550 PBN1YCL052C 1251 nt5.47□□□□□ -1.53
PDR11P40550 IES6YEL044W 501 nt5.46□□□□□ -1.54
PDR11P40550 TEF4YKL081W 1239 nt5.46□□□□□ -1.54
PDR11P40550 USA1YML029W 2517 nt5.46□□□□□ -1.54
PDR11P40550 GVP36YIL041W 981 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 YMR130WYMR130W 909 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 YNR061CYNR061C 660 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 YBR053CYBR053C 1077 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 CTR1YPR124W 1221 nt5.45□□□□□ -1.54
PDR11P40550 ERG7YHR072W 2196 nt5.44□□□□□ -1.54
PDR11P40550 YDR193WYDR193W 399 nt5.44□□□□□ -1.54
PDR11P40550 KTR2YKR061W 1278 nt5.44□□□□□ -1.54
PDR11P40550 BSC1YDL037C 987 nt5.43□□□□□ -1.54
PDR11P40550 SDS3YIL084C 984 nt5.43□□□□□ -1.54
PDR11P40550 UBP13YBL067C 2244 nt5.43□□□□□ -1.54
PDR11P40550 PEX29YDR479C 1665 nt5.43□□□□□ -1.54
PDR11P40550 HAL5YJL165C 2568 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.2 ms