Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 NOP8YOL144W 1455 nt5.53□□□□□ -1.52
VID28P40547 YDL157CYDL157C 357 nt5.53□□□□□ -1.52
VID28P40547 ARO2YGL148W 1131 nt5.53□□□□□ -1.52
VID28P40547 YLR198CYLR198C 360 nt5.53□□□□□ -1.52
VID28P40547 PRR2YDL214C 2100 nt5.53□□□□□ -1.52
VID28P40547 CLA4YNL298W 2529 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 HRR25YPL204W 1485 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 RRP14YKL082C 1305 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 ASA1YPR085C 1332 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 JAC1YGL018C 555 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 PSY3YLR376C 729 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 YBL077WYBL077W 432 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 RAD7YJR052W 1698 nt5.52□□□□□ -1.53
VID28P40547 SYP1YCR030C 2613 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 BUD22YMR014W 1560 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 RPL12AYEL054C 498 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 YKR047WYKR047W 306 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 ECM15YBL001C 315 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 YBL036CYBL036C 774 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 MTG1YMR097C 1104 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 PPG1YNR032W 1107 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 FEX1YOR390W 1128 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 YPL199CYPL199C 723 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 FEX2YPL279C 1128 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 CBP1YJL209W 1965 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 DAL81YIR023W 2913 nt5.51□□□□□ -1.53
VID28P40547 UBP7YIL156W 3216 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 PHO90YJL198W 2646 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 MPP10YJR002W 1782 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 RSM10YDR041W 612 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 COX3Q0275 810 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 SFK1YKL051W 1062 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 ATG33YLR356W 594 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 YMR178WYMR178W 825 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 YIP3YNL044W 531 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 RAD57YDR004W 1383 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 IFM1YOL023W 2031 nt5.5□□□□□ -1.53
VID28P40547 CMK1YFR014C 1341 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 KAR1YNL188W 1302 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 NOP2YNL061W 1857 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 AUA1YFL010W-A 285 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 Q0144Q0144 330 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 CIA2YHR122W 696 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 YKL023WYKL023W 834 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 YKR104WYKR104W 921 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 PAU17YLL025W 375 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 YLL047WYLL047W 384 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 HRT3YLR097C 1035 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 BUB3YOR026W 1026 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 YOR342CYOR342C 960 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 snR17bsnR17b 332 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 snR3snR3 194 nt5.49□□□□□ -1.53
VID28P40547 GIP1YBR045C 1920 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 TIP20YGL145W 2106 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 YHR182WYHR182W 2358 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 RVB1YDR190C 1392 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 YEL067CYEL067C 588 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 ARI1YGL157W 1044 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 CIR1YGR207C 786 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 RSF1YMR030W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 DIA1YMR316W 1011 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 ATG19YOL082W 1248 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 YBR016WYBR016W 387 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 AIM10YER087W 1731 nt5.48□□□□□ -1.53
VID28P40547 AAP1YHR047C 2571 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 POP6YGR030C 477 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 YIL089WYIL089W 618 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 TFA2YKR062W 987 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 SEC65YML105C 822 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 EFM2YBR271W 1260 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 SUP35YDR172W 2058 nt5.47□□□□□ -1.53
VID28P40547 IMD3YLR432W 1572 nt5.46□□□□□ -1.53
VID28P40547 PRO2YOR323C 1371 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 SIR1YKR101W 1965 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 snR63snR63 255 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 PHO92YDR374C 921 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 TCA17YEL048C 459 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 FSH1YHR049W 732 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 IMP3YHR148W 552 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 DCG1YIR030C 735 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 EMG1YLR186W 759 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 NEJ1YLR265C 1029 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 MPD1YOR288C 957 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 YBR089WYBR089W 600 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 CDC28YBR160W 897 nt5.46□□□□□ -1.54
VID28P40547 FAP1YNL023C 2898 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 RTG3YBL103C 1461 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 EIS1YMR031C 2532 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 YHR177WYHR177W 1362 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 MET3YJR010W 1536 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 CDC4YFL009W 2340 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 RAD53YPL153C 2466 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 VPS29YHR012W 849 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 YIL028WYIL028W 399 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 LAC1YKL008C 1257 nt5.45□□□□□ -1.54
VID28P40547 ARC19YKL013C 516 nt5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms