Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	SVF1	YDR346C	1446 nt		3.96	□□□□□ -1.77
SHE2	P36068	GCV1	YDR019C	1203 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ADK2	YER170W	678 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	BNA6	YFR047C	888 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	CBT1	YKL208W	816 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ISA1	YLL027W	753 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YML119W	YML119W	1074 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	RDL1	YOR285W	420 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	THS1	YIL078W	2205 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YMR221C	YMR221C	1515 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	SKG6	YHR149C	2205 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	STB2	YMR053C	2553 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	GAD1	YMR250W	1758 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	MKS1	YNL076W	1755 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ATG23	YLR431C	1362 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ARF2	YDL137W	546 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	MDM12	YOL009C	816 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	UMP1	YBR173C	447 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	SEN1	YLR430W	6696 nt		3.95	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	COQ4	YDR204W	1008 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	CAB1	YDR531W	1104 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	UBI4	YLL039C	1146 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	MRPL39	YML009C	213 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ATG14	YBR128C	1035 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	GSM1	YJL103C	1857 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	RAD52	YML032C	1416 nt		3.94	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	PRT1	YOR361C	2292 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	DAM1	YGR113W	1032 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	VPS29	YHR012W	849 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	TDA5	YLR426W	981 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YMR085W	YMR085W	1299 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	TOM7	YNL070W	183 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	PDX3	YBR035C	687 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YDC1	YPL087W	954 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	SPO19	YPL130W	672 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	TEL1	YBL088C	8364 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	WTM1	YOR230W	1314 nt		3.93	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	CNM67	YNL225C	1746 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	VPS73	YGL104C	1461 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YDL012C	YDL012C	324 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	snR7-L	snR7-L	214 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	SNF11	YDR073W	510 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	FAS2	YPL231W	5664 nt		3.92	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	HIS4	YCL030C	2400 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ARC1	YGL105W	1131 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ERG3	YLR056W	1098 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	FAR10	YLR238W	1437 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	MAG2	YLR427W	2013 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	PBN1	YCL052C	1251 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	PRM7	YDL039C	2097 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	RIA1	YNL163C	3333 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	AVT1	YJR001W	1809 nt		3.91	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	KCC4	YCL024W	3114 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	RRN11	YML043C	1524 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	HUL4	YJR036C	2679 nt		3.9	□□□□□ -1.78
SHE2	P36068	YDL027C	YDL027C	1263 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	THI13	YDL244W	1023 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	IRC7	YFR055W	1023 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	PFK1	YGR240C	2964 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NVJ1	YHR195W	966 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YIL165C	YIL165C	360 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	LOH1	YJL038C	660 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	KRE9	YJL174W	831 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	THI11	YJR156C	1023 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NTR2	YKR022C	969 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YLR125W	YLR125W	411 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	IZH3	YLR023C	1632 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NPL6	YMR091C	1308 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	PDR5	YOR153W	4536 nt		3.9	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	TRF5	YNL299W	1929 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	LPL1	YOR059C	1353 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	FPK1	YNR047W	2682 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	MDM30	YLR368W	1797 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	ATR1	YML116W	1629 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YDL094C	YDL094C	510 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	RAD27	YKL113C	1149 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	ARG8	YOL140W	1272 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NOP8	YOL144W	1455 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NHX1	YDR456W	1902 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	EMP47	YFL048C	1338 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YHR177W	YHR177W	1362 nt		3.89	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	VID30	YGL227W	2877 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	BSC5	YNR069C	1470 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YOL153C	YOL153C	1746 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	TRM8	YDL201W	861 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	SOL4	YGR248W	768 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	BIO2	YGR286C	1128 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YIL171W	YIL171W	330 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	NMA1	YLR328W	1206 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	YIF1	YNL263C	945 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	MIS1	YBR084W	2928 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	HOM3	YER052C	1584 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	BUD8	YLR353W	1812 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	TRE1	YPL176C	2352 nt		3.88	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	PMT5	YDL093W	2232 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	RPL24A	YGL031C	468 nt		3.87	□□□□□ -1.79
SHE2	P36068	REC114	YMR133W	1287 nt		3.87	□□□□□ -1.79

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