Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
L1CAMP32004 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1CAMP32004 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms