Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECHS1P30084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECHS1P30084 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms