Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A5P29400 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A5P29400 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A5P29400 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A5P29400 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A5P29400 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL4A5P29400 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A5P29400 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A5P29400 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A5P29400 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A5P29400 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A5P29400 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A5P29400 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A5P29400 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A5P29400 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A5P29400 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms