Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTGFP29279 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTGFP29279 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTGFP29279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTGFP29279 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTGFP29279 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTGFP29279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTGFP29279 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTGFP29279 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTGFP29279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTGFP29279 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTGFP29279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTGFP29279 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTGFP29279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTGFP29279 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms