Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLD1P28340 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLD1P28340 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLD1P28340 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLD1P28340 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLD1P28340 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLD1P28340 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD1P28340 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD1P28340 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLD1P28340 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLD1P28340 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLD1P28340 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms