Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PEX2P28328 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PEX2P28328 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PEX2P28328 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PEX2P28328 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEX2P28328 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEX2P28328 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PEX2P28328 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PEX2P28328 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PEX2P28328 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PEX2P28328 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PEX2P28328 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms