Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCR1P25024 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCR1P25024 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms