Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF4P23510 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF4P23510 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms