Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRZ1P23471 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRZ1P23471 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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