Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A1P20849 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A1P20849 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms