Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL3P19876 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms