Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF2RAP15509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF2RAP15509 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF2RAP15509 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms