Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB3P14651 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB3P14651 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms