Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LYL1P12980 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LYL1P12980 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LYL1P12980 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LYL1P12980 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LYL1P12980 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYL1P12980 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYL1P12980 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LYL1P12980 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LYL1P12980 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LYL1P12980 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms