Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRFP10586 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRFP10586 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRFP10586 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms