Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD2P0DJD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RGPD2P0DJD1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RGPD2P0DJD1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms