Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTBP09497 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTBP09497 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTBP09497 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTBP09497 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTBP09497 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTBP09497 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTBP09497 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTBP09497 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTBP09497 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTBP09497 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTBP09497 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLTBP09497 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLTBP09497 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTBP09497 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLTBP09497 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLTBP09497 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTBP09497 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTBP09497 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTBP09497 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTBP09497 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLTBP09497 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLTBP09497 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTBP09497 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTBP09497 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTBP09497 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLTBP09497 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms