Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RETP07949 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETP07949 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETP07949 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RETP07949 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RETP07949 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RETP07949 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RETP07949 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RETP07949 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RETP07949 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RETP07949 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RETP07949 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RETP07949 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RETP07949 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETP07949 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RETP07949 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms