Protein–RNA interactions for Protein: P07477

PRSS1, Trypsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS1P07477 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRSS1P07477 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRSS1P07477 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms