Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLBP06746 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLBP06746 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLBP06746 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLBP06746 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLBP06746 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLBP06746 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLBP06746 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLBP06746 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLBP06746 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLBP06746 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLBP06746 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLBP06746 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLBP06746 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLBP06746 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms