Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SERPINC1P01008 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SERPINC1P01008 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms