Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJB5O95377 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJB5O95377 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJB5O95377 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJB5O95377 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB5O95377 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB5O95377 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB5O95377 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB5O95377 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB5O95377 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB5O95377 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB5O95377 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB5O95377 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB5O95377 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB5O95377 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB5O95377 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB5O95377 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB5O95377 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms