Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPINO95295 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPINO95295 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms