Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRMUO75648 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRMUO75648 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRMUO75648 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRMUO75648 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRMUO75648 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRMUO75648 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRMUO75648 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms