Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKAP2O75563 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms