Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BANF1O75531 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BANF1O75531 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BANF1O75531 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BANF1O75531 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BANF1O75531 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BANF1O75531 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BANF1O75531 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BANF1O75531 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BANF1O75531 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BANF1O75531 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BANF1O75531 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BANF1O75531 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BANF1O75531 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BANF1O75531 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BANF1O75531 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms