Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITX3O75364 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITX3O75364 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITX3O75364 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITX3O75364 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX3O75364 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX3O75364 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX3O75364 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX3O75364 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PITX3O75364 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PITX3O75364 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PITX3O75364 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PITX3O75364 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms