Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PLXNC1O60486 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PLXNC1O60486 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLXNC1O60486 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms