Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTRA2O43464 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA2O43464 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA2O43464 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms