Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TBX1O43435 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TBX1O43435 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TBX1O43435 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TBX1O43435 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TBX1O43435 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TBX1O43435 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TBX1O43435 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TBX1O43435 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TBX1O43435 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TBX1O43435 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms