Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCF2LO15068 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms