Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOCS3O14543 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS3O14543 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms