Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX39AO00148 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX39AO00148 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX39AO00148 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms