Protein–RNA interactions for Protein: J3QL48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QL48 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3QL48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3QL48 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3QL48 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3QL48 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
J3QL48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
J3QL48 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
J3QL48 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms