Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BRB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BRB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BRB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BRB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BRB1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BRB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H3BRB1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H3BRB1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H3BRB1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H3BRB1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BRB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BRB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H3BRB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BRB1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BRB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BRB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BRB1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H3BRB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BRB1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BRB1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BRB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BRB1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H3BRB1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H3BRB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
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